Canoco 5免费版

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Canoco 5免费版软件功能

主要响应曲线(PRC)的计算，测试和绘图现在是一项简单的任务。

可以使用协同对应分析(CoCA，对称形式)，包括两种比较社区类型之间协变的蒙特卡罗排列测试。

预测器的逐步选择在视觉上得到增强，现在提供对I型错误膨胀的保护支持(所有预测器的初步测试和通过三种方法之一调整p值：错误发现率(FDR)估计，Holm校正和Bonferroni)更正。

可以直接测试所有约束轴，并将两个坐标的结果与Procrustes分析进行比较。

您可以轻松处理物种功能特征或导入物种的系统发育相关性数据，以及计算和使用功能多样性。

可视化功能通过半透明填充颜色，在排列图中显示可变'箭头的校准轴，或绘制封闭椭圆作为封闭多边形的替代方案等功能得到增强。其他类型的JPEG，TIFF和PDF文件格式的导出已添加到现有(PNG，BMP，EMF，Adobe Illustrator)。

您的工作的每一步都由上下文相关的帮助系统和Canoco Adviser支持 - Canoco Adviser是一个专家系统，可帮助您为研究问题选择合适的分析方法，纠正排序模型的类型(线性与单峰)，数据转换，或结果的适当可视化。它甚至建议您如何解释您在图形向导的帮助下创建的排序图。

高级用户可以在一次分析中组合多种方法，包括广义线性模型以关联分数等。

分析和绘图功能与易于使用的电子表格数据编辑器集成在一个程序中。现在，在Canoco 5项目中收集了对一组数据表进行的所有分析，共享分析和绘图设置。

Canoco for Windows 4.5提供的所有统计方法都可用，例如DCA，CA，CCA，DCCA，PCA和RDA方法 - 包括它们的部分变体，使用受约束排序方法的蒙特卡罗排列测试，为即将到来的数据提供适当的排列设置来自非平凡的抽样设计。

CanoDraw 4.x提供的所有可视化工具都可用(包括用于可视化排序空间中数据属性的黄土，GLM和GAM模型)，其中许多都得到了改进。

数据可以在程序中输入，也可以从Excel(.XLS或.XLSX格式)或Canoco 4.x数据文件轻松导入。标签不再需要缩短为8个字符，但这些简短形式仍可在排序图中显示，甚至可以从长标签中自动生成。现在使用标准的因子编码(分类预测器)，在内部生成虚拟(0/1)变量。编辑器允许从虚拟变量转换为因子，如果需要，则反转。

现在可以轻松访问主坐标分析(PCoA)和基于距离的RDA(db-RDA)，增加了新的距离测量(总共11种距离类型，包括Bray-Curtis，Gower距离或Jaccard系数)。类似地，还支持非度量多维缩放(nMDS)。

对于两组或三组预测变量，可以轻松访问变异分区，包括根据部分或非部分分析计算所解释变量的各个分数，并使用原始或调整后的变异估计。

邻域矩阵的主坐标(PCNM)方法在变体分区框架内可用。当前实现与Legendre&Legendre(2012)中描述的建议匹配替代方法名称(dbMEM)。

Canoco 5免费版使用教程

如何显示排序分数值?

在Canoco 5分析中，仍然可以从解决方案(.SOL)文件中获得CANOCO 4.x版本中的排序分数和其他排序统计数据，但通常不会显示它们。当您在特定用户帐户上开始使用Canoco 5时，分析笔记本将以简短模式显示，仅显示摘要页面和已创建的图表，其他信息(排序分数和分析日志)将被隐藏。要以非简短模式显示分析笔记本，您必须选择编辑| 设置| Canoco5选项命令从主菜单和Canoco选项对话框的常规页面中取消选中“显示带分析结果的笔记本的简短版本”框：

然后用OK按钮关闭对话框。

请注意，在更改选项后，已显示的笔记本不会更改其内容。您必须关闭笔记本(例如，使用分析列表下方的“ 隐藏”按钮)，然后再次重新打开它(例如，使用“ 显示”按钮替换“ 隐藏”按钮，以便使用已关闭的笔记本进行分析)。隐藏和重新显示分析笔记本时，您应该注意，如果定义了多个分析并且隐藏了分析笔记本，则焦点通常会切换到另一个分析。因此，要重新打开原始分析的分析笔记本，必须在分析列表中重新选择它。

得分页面中显示的分数可以复制到剪贴板，并在Canoco 5程序内部或外部进一步重复使用。有两个用于复制所选分数列的上下文菜单命令：复制分数复制表格内容，如分数页面中所示，而扩展复制将行集与对应的数据项集(案例，响应变量等)对齐。项目：当您想要将计算得分作为新数据表复制到项目中时，这很重要(分析输出中可能缺少某些数据项，另一方面，因子变量会生成多组得分)。

如何从分析中省略案例或响应变量?

当您开始在特定用户帐户上使用Canoco 5时，Analysis Setup Wizard将以所谓的QuickWizard模式显示。这反映在QuickWizard按钮(由以下快照中的红色矩形强调)中显示为处于按下状态。

无论何时想要省略(或加权)个案或响应变量，在创建新分析(例如，单击分析列表下方的“ 新建”按钮)之前，必须通过单击此按钮(其外观变为平坦)来关闭QuickWizard模式。 )或在更改现有分析的选项之前(例如，通过单击“ 修改”按钮，然后在现有分析中选择“ 替换”)。

关闭QuickWizard模式后，Analysis Setup Wizard会显示更多页面，包括Response和Explanatory Data页面：

如果您检查(如上面的快照中)标有“选择”的一个或两个框...，安装向导将稍后显示相应的页面，其中可以选择案例和/或响应变量的子集进行分析。

要再次打开QuickWizard模式，请单击工具栏中的相同按钮(它是一个切换按钮)。

您可以使用Project |定义案例组和变量组 团体| ...菜单命令然后使用设置向导的相应项目选择页面上的“ 从”组按钮选择或省略属于特定组的个案或变量。

Canoco 5免费版常见问题

Canoco 5可以在Linux或MacOS上运行吗?

Canoco 5没有针对这些操作系统的本机实现，但Canoco 5经过测试，可在Linux上的Wine环境下运行，同样在CrossOver包的类似环境中运行。以下快照说明了如何在Ubuntu Linux工作区中使用双时隙图。

Canoco 5是64位程序吗?

现在Canoco 5软件包中只有一个应用程序，安装程序在64位Windows上安装64位版本，在32位Windows上安装32位版本。读取和存储的文件在32位和64位版本的Canoco 5之间兼容。

Canoco如何处理Oksanen&Minchin(1997)报告的稳定性问题?

最初的DECORANA(Hill，1979)Detrended Correspondence Analysis代码中的错误已在15年前的Canoco 4版本之前进行了研究和修复。事实证明，Oksanen和Minchin(1997)提出的改变并没有使平滑常规顺序不变。根据Oksanen&Minchin在随后的通信中达成的协议还需要进行另一项更改 。

Canoco 5能提供NMDS吗?

是的，非度量多维缩放(NMDS或NMS)方法现已完全集成到Canoco 5中，取代了以前版本的附加程序WinKyst。WinKyst程序仍然可用作执行NMDS分析的免费替代解决方案。

是否可以为旧版本的用户升级?

是的，您可以从旧版本的Canoco升级。请联系您购买原始Canoco版本的经销商，以获得有关可用性和定价的更准确信息(Scientia客户，请参阅问题10)。

Canoco 5可以在Windows 8/10和其他Windows平台上运行吗?

在Canoco 5发布时，Canoco可以在32位和64位版本的Windows 8,8.1或10的标准台式机和笔记本电脑上正常工作。Window 8.x和10还支持其他平台，例如用手指触摸屏幕管理的小型移动设备，但是，正如任何程序分析和可视化科学数据一样，Canoco 5也不会擅长。

Canoco 5也适用于其他Microsoft操作系统，从安装了SP(service pack)2或SP3的Microsoft Windows XP开始。这还包括Windows Vista和Windows 7。