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Haplotype frequency estimation(单倍型频率估计)
Linkage disequilibrium(连锁不平衡:检测不同位点上等位基因的非随机关联)
Hardy-Weinberg equilibrium(哈温-伯格平衡)
Molecular diversity(分子多态性)
Mismatch distribution(错配分布)
Chakraborty`s amalgamation test (Chakraborty`s 融合检验,检测人群的均一性或同质性和中性选择等)
Minimu Spanning Network(MSN,最小扩张树或称之为最小支撑树,,基于分子差异)
AMOVA 分子差异度分析,用以评测人群的遗传结构
Pairwise genetic distances (遗传距离的估计)
Exact test of population differentiation (检测随机交配群体单倍型的非随机分布)
Assignment test of genotype (通过估计等位基因频率将单个基因型分配到特定的人群中)
Tajima`s neutrality test(Tajima中性检验)
Fu`s neutrality test(Fu中性检验)
Ewens-watterson neutrality test(Ewens-watterson中性检验)
以上三个中性检验都是基于无限位点模型,适用于DNA sequence 和 RFLP单倍型。
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