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很多做专业研究的人应该会需要Gene Runner软件,这是一款基因序列分析,功能都是非常专业的,能够让你可以进行各种数据分析,Gene Runner软件对生物研究院们应该是非常需要的软件吧,目前该软件还不支持中文的,有需要的可以去看看呢!
生物基因分析Gene Runner是一个专业的应用,为遗传学家和生物学家提供了可靠的工具,可以帮助他们进行基因分析提供方便。
该应用程序需要包含遗传信息序列格式的文件,然后可以使用“ORF”(开放阅读框)按钮,使用户能够设置首选核苷酸或氨基酸大小,以及选择“转换表”分析一起工作。开的ORF项目后,用户可进行各种注释为每个条目。
1、查找:在此框中输入查询序列。查询序列可能包含IUPAC通配符。碱基或氨基酸总数显示在查询框右侧的框中。也可以使用shift+ins或ctrl+v键从剪贴板粘贴查询序列(打开对话框窗口时,不能使用菜单中的编辑粘贴)。这个发现只接受一个字母的氨基酸代码。在一个或三个字母的代码显示中可以找到合适的氨基酸。如果find以前用于当前序列,请键入以前搜索的文本。每个序列都有自己的查找内存。
2、标准是对在“查找:”框中输入的查询序列的正常搜索。用于简单搜索或核酸搜索,所有碱基/氨基酸必须完全匹配。
3、主题:当搜索设置为蛋白质时,单击向下箭头显示Prosite主题的下拉列表。有关prosite及其序列约定的说明,请参见下文。当设置为核酸时,将显示核酸基序列表。选择所需的主题。然后,Motif会自动输入find:框中。此特征允许识别TATA盒、AP1结合位点、N-糖基化位点等。
4、类型:确定执行的搜索类型:标准、主题或不匹配。
5、motif是在motif框中搜索查询序列,或使用prosite约定在find:框中输入的序列,请参见下文。蛋白质和核酸的基序可以以相同的惯例输入。注意:此搜索比标准搜索慢。
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